案例一
自然人股东注册资金1000万元，实缴为0元，股权转让日未分配利润0元，净资产总计0元，企业账上没有高溢价资产存在。
请问：
自然人股东股权转让按照0元转让，如何申报印花税？
答复：
印花税也是按照0元申报就可以。
案例二
自然人股东注册资金1000万元，实缴为0元，股权转让日未分配利润100万元，净资产总计100万元，企业账上没有高溢价资产存在。
请问：
自然人股东股权转让按照0元转让，如何申报印花税？
答复：
当时股东实缴为0元，并不代表财产转让的“申报纳税收入”可以是0元，若申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额，则视为股权转让收入明显偏低，税局照样给你核定转让价格。
因此，建议按照100万元的收入来申报股权转让的印花税。
提醒：
产权转移书据应按所载金额的万分之五贴花。自然人股东由于属于小规模纳税人，目前享受减半征收印花税的优惠。
看看深圳税局在2019年的回复：
注册资金未实缴的情况下，0元转让股权，是否缴纳印花税？（回复单位：国家税务总局深圳市税务局回复时间：2019-11-07）
答：根据《中华人民共和国税收征收管理法》（中华人民共和国主席令第49号）第三十五条的规定，纳税人有下列情形之一的，税务机关有权核定其应纳税额：（六）纳税人申报的计税依据明显偏低，又无正当理由的。
因此，建议纳税人携带具体合同资料前往主管税局判定。感谢您的咨询！上述回复仅供参考，若您对此仍有疑问，请联系12366纳税服务热线或主管税务机关。
参考
《中华人民共和国印花税暂行条例》
第二条 下列凭证为应纳税凭证：
（一）购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证；
（二）产权转移书据；
（三）营业账簿；
（四）权利、许可证照；
（五）经财政部确定征税的其他凭证。
产权转移书据：包括财产所有权和版权、商标专用权、专利权、专有技术使用权等转移书据， 立据人按所载金额万分之五贴花 。
